Mira, a ver si así me entiendes:
Código PHP:
<?php
<if usuario == admin then>
//esto lo ven los admins.
<elseif usuario = mod then>
//esto lo ven los mods.
<else>
//esto lo ven los demás.
</if>
Ese es un ejemplo de como funciona Template Conditionals, claro, es un ejemplo simple y que no funcionara, es solo para ver si entiendes como funciona.
Claro, el que Template Conditionals oculte eso no significa que no puedan seguir usándolo, es allí cuando entra el MyPermissios, que ese si bloquea
algunas cosas.