Primero: Esto va en Soporte de MyBB 1.x.x(la version que sea)
Segundo: Si questa en el Admin CP, concretamente en Estilos y Plantillas, en la plantillas Cabecera/Header, en donde quieras crear mas bloques y modificar, y ahi dentro empiezas ha modificar lo que quieras.
Con un aremota idea de html puedes modificar la plantilla que te dijo aeroxis y ahi pones los links y bloques que quieras.

Saludos

PD: muevo a soporte
ejemplo:

{$pms}
<table border="0" cellspacing="{$theme['borderwidth']}" cellpadding="{$theme['tablespace']}" class="tborder">
<tr>
<td class="thead"><strong>Bloque personalizado</strong></td>
</tr>
<tr>
<td class="trow1" align="center">

Aqui tu contenido

</td>
</tr>
</table>
<br />
{$latest_news}

asi vas haciendo las modificaciones y los metes en donde quieras, ya sea derecha izquierda o centro =).
esto se hace en la plantilla "portal"

si quieres mira como tengo midificadas mis webs:

http://reloadfansub.comfree.com
http://japanimationfansub.com.ar