bueno amigo mas atención la solución que le dio el amigo vender es la correcta el error ocurrió por una omisión o desconocimiento del autor del tema que creo mal el formulario para el buscador seguramente como dice nuestro compañero alimento el campo action del formulario  de la siguiente manera 
<form method="post" action="/search.php">
 la forma correcta debería ser
<form method="post" action="{$mybb->settings['bburl']}/search.php">
así se encontrara el archivo correctamente aun cuando este en un subdirectorio del dominio...