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actualizaciones 1.6
Hola amigos quisiera saber que en lugar que aparezca la publicidad de arriba ponerle un buscador para que encontre mas faciles los temas pero que sea un buscador personalizado de google

Supongo que quieres algo igual a esto?
www.sedeves.com jeje bueno en el header remplaza todo lo del logo por esto

<div id="headersection">
<div class="header">
<div class="logo"><a href="{$mybb->settings['bburl']}/index.php"><img src="{$theme['logo']}" border="0" alt="{$mybb->settings['bbname']}"/></a></div>
<div class="banner">

<FORM method=GET action="http://www.google.com/search" target="_blank"> 
<TABLE><tr><td> 
<font size="4" color="#EFEFEF"><b>Buscar En Google</b></font><br>
<INPUT TYPE=text name=q size=31 maxlength=255 value=""> 
<INPUT TYPE=hidden name=hl value=es> 
<INPUT type=submit name=btnG VALUE="Búsqueda Google"> 
</td></tr></TABLE> 
</FORM>
</div>
</div>

None

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Espero te sirva xD!

Saludos!

amigo bueno esta bien hasta en la parte del buscador pero quiero que busque contenidos de mi pagina no de todo google
el motor de busqueda personalizado aca esta el codigo

<div id="cse" style="width: 100%;">Loading</div>
<script src="http://www.google.com/jsapi" type="text/javascript"></script>
<script type="text/javascript">
  google.load('search', '1', {language : 'es'});
  google.setOnLoadCallback(function() {
    var customSearchControl = new google.search.CustomSearchControl('007524266518564457334:blymtwy5hl0');
    customSearchControl.setResultSetSize(google.search.Search.FILTERED_CSE_RESULTSET);
    var options = new google.search.DrawOptions();
    options.setAutoComplete(true);
    customSearchControl.draw('cse', options);
  }, true);
</script>
<link rel="stylesheet" href="http://www.google.com/cse/style/look/default.css" type="text/css" /> 

None

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tambien quisiera agregar el boton que dice Foro al lado del portal

Pues ponlo así
<FORM method=GET action="search.php" target="_blank">
<TABLE><tr><td>
<font size="4" color="#EFEFEF"><b>Buscar</b></font><br>
<INPUT TYPE=text name=q size=31 maxlength=255 value="">
<INPUT TYPE=hidden name=hl value=es>
<INPUT type=submit name=btnG VALUE="Búsqueda Google">
</td></tr></TABLE>
</FORM>

amigo no se mucho pero explicame en donde ponerlo o que debo poner

En header ,donde pusiste el otro code ,pon este
<FORM method=GET action="search.php" target="_blank">
<TABLE><tr><td>
<font size="4" color="#EFEFEF"><b>Buscar</b></font><br>
<INPUT TYPE=text name=q size=31 maxlength=255 value="">
<INPUT TYPE=hidden name=hl value=es>
<INPUT type=submit name=btnG VALUE="Búsqueda Google">
</td></tr></TABLE>
</FORM>