tuve el mismo problema (hace momentos) y es por el
jQuery & Prototype de mi plugin (My ImageBox)

edita esto:
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function(){
$(".myimage").fancybox({ });
});
</script>
por esto:
<script type="text/javascript">
jQuery.noConflict();
jQuery(document).ready(function($)
{ $('.myimage').fancybox({ }); });
</script>
O usa la nueva version:
http://www.mybb-es.com/hilo-plugin-myimagebox
Igual esto puede pasar en varios scripts en jQuery, añade
jQuery.noConflict();
para evitar problemas.
Perdon, si demore.