Seguramente te falta esto en el header para que te salten los alertas 
viste que en el theme default que te mandan un MP y te salta una barrita amarrilla arriba del navigation esas barras ;P
Lo pones a lo ultimo del header y te deberian saltar esos alerta, el de profile comment te viene un codigo asi parecido a lo que muestro en el header para que te salte el alerta del profile comment, deberias buscarlo y ponerlo.
[Imagen: https://31.media.tumblr.com/b9f3b87cfcc8...r1_500.gif]
viste que en el theme default que te mandan un MP y te salta una barrita amarrilla arriba del navigation esas barras ;PCódigo PHP:
{$pm_notice}
{$bannedwarning}
{$bbclosedwarning}
{$unreadreports}
{$pending_joinrequests}
