Abran ./inc/plugins/profilecomments.php y busquen:
	public function comment_new($uid, $who, $text)
	{
		global $mybb, $db;
		$data = array(
			'user' => $uid,
			'sender' => $who,
			'text' => $db->escape_string($text),
			'date' => time()
		);
		$db->insert_query('profilecomments', $data);
		return TRUE;
	}
Cambien por:
	public function comment_new($uid, $who, $text)
	{
		global $mybb, $db, $Alerts;
		$data = array(
			'user' => $uid,
			'sender' => $who,
			'text' => $db->escape_string($text),
			'date' => time()
		);
		$cid = $db->insert_query('profilecomments', $data);
		if(!empty($Alerts) && is_object($Alerts)) 
		{
			$Alerts->addAlert($uid, 'profile_comment', $cid, $who); 
		}
		return TRUE;
	}
Abran ./inc/plugins/myalerts.php y busquen:
	$plugins->run_hooks('myalerts_alerts_output_end', $alert);
Agreguen antes:
	elseif ($alert['alert_type'] == 'profile_comment')
	{
		$alert['threadLink'] = $mybb->settings['bburl'].'/'.get_profile_link($mybb->user['uid']);
		$alert['message'] = 'You have a new profile comment.';
		if($user = get_user($alert['from_id']))
		{
			$alert['message'] = $lang->sprintf('You have a new profile comment from {1}.', htmlspecialchars_uni($user['username']));
		}
		$alert['rowType'] = 'postAlert';
	}
Busquen en el mismo archivo:
	$possible_settings = array(
		'rep',
		'pm',
		'buddylist',
		'quoted',
		'post_threadauthor',
		);
Agreguen despues:
$possible_settings[] = 'profile_comment';
Ahora, si les importa actualizar usuario y no tienen muchos, peguen esto al final de global.php y entren a su index como administradores.
if($mybb->usergroup['cancp'])
{
	$query = $db->simple_select('users', 'uid, myalerts_settings', 'myalerts_settings!=\'\'');
	while($user = $db->fetch_array($query))
	{
		$settings = json_decode($possible_settings, true);
		$settings['profile_comment'] = 1;
		$settings = json_encode($settings);
		$db->update_query('users', array('myalerts_settings' => $db->escape_string($settings)), 'uid=\''.(int)$user['uid'].'\'');
	}
}
Esto ultimo no tengo idea de si funciona, igual podrian decirle a sus usuarios que actualizen sus opciones y desactivar las notificaciones del ProfileComments por ocmpleto para presionarlos rapido.