Cordial saludo.

Me gustaría saber como puedo cambiar el editor que trae por defecto mybb para temas nuevos, o en general, para toda función donde se escriben mensajes, por ejemplo, reemplazarlo con CKE editor.

Agradezco si hay alguna información al respecto.

Para CKE Editor puedes usar un complemento o plugin :
https://community.mybb.com/mods.php?action=view&pid=657

Este es el que encontré mas reciente y actualizado.

La carpeta jscripts e inc se suben a la raíz de tu foro, donde ya existen estas carpetas, y luego se activa el complemento en el panel de control de administración (PCA, ACP).